Для начала проверяем вид начисления.
Смотрим, какой вид.
Зарплата - начисления организации - оклад по дням (пример) – вкладка учет - настраиваем облагается, не облагается налогами. На картинке начисление облагается налогами.
Обратите внимание, налоги с заработной платы могут не считается в том случае, когда документ начисления заполнили, но не рассчитали.
